Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smad9Q9JIW5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad9Q9JIW5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms