Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms