Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cxcr6Q9EQ16 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cxcr6Q9EQ16 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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