Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tm9sf1Q9DBU0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tm9sf1Q9DBU0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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