Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrpraQ9DBG7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SrpraQ9DBG7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms