Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms