Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atg7Q9D906 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms