Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SlirpQ9D8T7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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