Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rexo2Q9D8S4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rexo2Q9D8S4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms