Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Q9D8Q6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms