Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms