Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cldn22Q9D7U6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn22Q9D7U6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn22Q9D7U6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn22Q9D7U6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn22Q9D7U6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn22Q9D7U6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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