Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc130Q9D516 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms