Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lonrf3Q9D4H7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lonrf3Q9D4H7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms