Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vsig1Q9D2J4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms