Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SarnpQ9D1J3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SarnpQ9D1J3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms