Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps28Q9D1C8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vps28Q9D1C8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms