Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl52Q9D0Y8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms