Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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