Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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Ccdc47Q9D024 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc47Q9D024 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc47Q9D024 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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