Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Shmt2Q9CZN7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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