Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Mrpl55Q9CZ83 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms