Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Bud23Q9CY21 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Bud23Q9CY21 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Bud23Q9CY21 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Bud23Q9CY21 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Bud23Q9CY21 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bud23Q9CY21 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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