Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ndufs4Q9CXZ1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ndufs4Q9CXZ1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms