Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rpl11Q9CXW4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms