Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV1

Mcm8, DNA helicase MCM8, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcm8Q9CWV1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Mcm8Q9CWV1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Mcm8Q9CWV1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms