Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rhobtb3Q9CTN4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms