Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nicn1Q9CQM0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nicn1Q9CQM0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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