Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPY4

Cdk2ap2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2ap2Q9CPY4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms