Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atg3Q9CPX6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms