Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrbp1Q99PL5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms