Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ms4a4dQ99N05 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ms4a4dQ99N05 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms