Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tdrd1Q99MV1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tdrd1Q99MV1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms