Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PtprtQ99M80 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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PtprtQ99M80 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprtQ99M80 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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