Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Usp16Q99LG0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp16Q99LG0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms