Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gps1Q99LD4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gps1Q99LD4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms