Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q99KU6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q99KU6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q99KU6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q99KU6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms