Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf34Q99KR6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf34Q99KR6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms