Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prpf19Q99KP6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prpf19Q99KP6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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