Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlcd1Q99JT6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tlcd1Q99JT6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms