Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspan1Q99J59 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspan1Q99J59 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms