Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ctu1Q99J10 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctu1Q99J10 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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