Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf144aQ925F3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms