Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sf3b5Q923D4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sf3b5Q923D4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sf3b5Q923D4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sf3b5Q923D4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Sf3b5Q923D4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sf3b5Q923D4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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