Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpe65Q91ZQ5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms