Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csde1Q91W50 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csde1Q91W50 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms