Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klc3Q91W40 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klc3Q91W40 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms