Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ccdc71Q8VEG0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ccdc71Q8VEG0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc71Q8VEG0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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