Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ttc39cQ8VE09 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms