Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8VDP2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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